VIII Taller GBIF.ES: Imágenes digitales para estudios de biodiversidad
Descripción:
Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.
Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.
Este taller está dirigido a profesionales y científicos que trabajan con especímenes de colecciones de historia natural y en proyectos de investigación sobre biodiversidad. Está especialmente orientado a aquellos interesados en el tratamiento y la publicación en Internet de imágenes digitales, preferentemente en el ámbito de GBIF.
IMPORTANTE: Es conveniente que los alumnos aporten sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto, así como sus propios ejemplares para fotografíar para tratar de resolver los problemas que se presenten.
ATENCIÓN: las fechas correctas del taller son del 5 al 7 de noviembre de 2024 (tres días).
Pasos a seguir para matricularse:
Rellenar el formulario de inscripción hasta el 11 de octubre de 2024.
La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 22 de octubre de 2024.
Publicación de la lista de alumnos en la página web del taller el 29 de octubre de 2024.
Proceso de selección:
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Los talleres organizados por GBIF.ES no conllevan gastos de inscripción, pero los gastos derivados del curso (transporte, alojamiento y manutención) han de ser cubiertos por cada participante.
Programa
PARTE I: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL.
Martes, 5 noviembre 2024
09:30-10:00 – Bienvenida e introducción al curso. GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
10:00-11:00 – Sesión introductoria: teoría de la imagen digital
Nociones básicas sobre imagen
· Naturaleza de la luz
· Óptica y formación de la imagen
· Teoría del color
Sistemas de imagen digital
· Sensores digitales y respuesta electrónica
· Componentes ópticos y electrónicos
· Cámaras y escáneres
· Iluminadores
· Sistemas no ópticos
Repaso de fotografía básica
· Sensibilidad, apertura, velocidad
· Profundidad de campo
· Saturación, iluminación y balance de blancos
· Control de brillos
Equipos
· Estudio fotográfico
· Mesas
· Soportes, superficies, fondos
· Ópticas, macros y lentes
· Equipos auxiliares: estativos, trípodes, cajas de luz, controles remotos
Software de tratamiento y análisis
· Controladores de hardware y adquisición
· Gestores de archivos e imágenes
· Editores de imagen
· Procesadores de imagen: apilamientos y cosido.
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: adquisición de imagen I
Fotografiado de elementos bidimensionales
· Estructuras zoológicas bidimensionales
· Plantas de herbario
· Láminas, papel, documentos
13:30-15:00 – Pausa para comer
15:00-16:30 – Sesión teórico-práctica: adquisición de imagen II
Fotografiado de elementos tridimensionales
· Tipos de sistemas de iluminación
· Planos y ángulos de imagen
· Problemas asociados al tamaño del ejemplar
· Motorización
Fotomicroscopía
· Estereomicroscopio
· Microfotografía y técnicas de contraste
· Adaptadores a bajo coste
16:30-17:00 – Pausa para café
17:00-18:00 – Sesión teórico-práctica: adquisición de imagen III
Casos especiales
· Cajas de colección
· Material en líquido
· Transparencias y reflejos. Polarización
· Imagen para clasificación automática
· Estereopares
· Morfometría
Miércoles, 6 noviembre 2024
09:00-11:00 – Sesión teórico-práctica: prevención de problemas en la imagen I
Problemas del sistema fotográfico
· Resolución
· Color
· Geometría
· Artefactos
· Costes (flujo de trabajo)
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: prevención de problemas en la imagen II
Problemas informáticos
· Pérdida de información
· Conservación, archivo y durabilidad
· Compatibilidad de formato
· Conversión entre formatos
13:30-15:00 – Pausa para comer
15:00-16:30 – Sesión teórico-práctica: postprocesado y análisis de imagen
Procesos generales de la imagen y retoque
· Reencuadre, recorte y redimensión
· Ajuste de gama dinámica
· Correcciones cromática y geométrica
· Mejora de la imagen: limpieza y nitidez
· Tratamientos parciales en la imagen
· Segmentación y filtros
· Procesamiento en lotes
Combinaciones de imágenes
· Álgebra de imagen
· Montaje fotográfico
· Stacks y automontaje
· Extensión de gama dinámica
Formatos de imagen
· Conversión entre formatos
· Formatos de compresión
· Información EXIF: propiedad intelectual, metadatos de imagen…
16:30-16:45 – Pausa para comer
16:45-18:00 – Sesión práctica: fotografiado de casos
PARTE II: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES DE BIODIVERSIDAD EN INTERNET
Jueves, 7 noviembre 2024
09:30-11:00 – Accesibilidad de imágenes en internet
· Proyectos y bibliotecas digitales en Internet (Flora brasiliensis, Herbario de Berlín, Morphbank, etc).
· Servidores de imágenes (eRez, IIPImage, Omeka) vs Repositorio de imágenes.
· Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).
· Publicación de imágenes en la infraestructura de GBIF.ES y de GBIF (protocolos, estándares, portales).
11:00-11:30 – Pausa para café
11:30-13:30 – La publicación de imágenes
· Ejemplo guiado de publicación de imágenes.
· Caso práctico I: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
· Iniciativas internacionales sobre imágenes digitales en biodiversidad. Proyectos y estándares.