De la publicación de datos a la publicación de artículos científicos "data papers"
Descripción:
Los datos de biodiversidad a menudo no son fácilmente accesibles ni visibles. Entre los obstáculos para su publicación está la falta de incentivos a los proveedores. De acuerdo con la estrategia de GBIF y algunas editoriales científicas, este taller propone la publicación de artículos de datos (data papers) como mecanismo para dar reconocimiento académico al esfuerzo realizado por los proveedores de datos.
La última versión de la herramienta IPT (Integrated Publishing Toolkit), desarrollada por GBIF, incorpora una función que facilita este proceso de conversión de las descripciones de los juegos de datos de biodiversidad (metadatos) en artículos de datos o data papers listos para su publicación en alguna de las revistas Pensoft: PhytoKeys, ZooKeys, BioRisk and NeoBiota.
El objetivo de este taller es que al final del mismo cada participante haya preparado y enviado a la revista su propio "data paper" basado en su juego de datos utilizando la herramienta de GBIF.
La convocatoria de este taller está restringida a los responsables (técnicos, adeministradores, etc.) de juegos de datos que ya publican en GBIF o que lo harán próximamente.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Para facilitar la participación en este taller se cuenta con una ayuda económica del Secretariado Internacional de GBIF. Ver formulario más abajo.
Programa
Día 1. Martes, 19 de marzo
En la primera jornada, veremos la importancia de publicar datos, qué datos son publicables y cómo hacerlo. Presentaremos la herramienta de GBIF Integrated Publishing Toolkit (IPT) trabajando con un conjunto de datos común para todos los participantes.
09:30 – 11:00. Bienvenida e introducción al curso.
- Datos: ¿por qué publicarlos?
- Licencias
- Estandarización de datos: Darwin Core Archive
- Repositorios de datos
11:00 – 11:30. Pausa para café.
11:30-12:30. Publicar datos
- Datos como archivo suplementario
- Un artículo de datos (data paper)
- Qué es (y qué no es) un artículo de datos
- Estructura.
- Ejemplos.
12:30 – 13:30. Integrated Publishing Toolkit (IPT).
13:30 – 14:30. Pausa para comida.
14:30 – 16:00. Integrated Publishing Toolkit (IPT). ∞Continuación∞.
16:00 – 16:30. Pausa para café.
16:30 – 17:30. Integrated Publishing Toolkit (IPT). ∞Continuación∞.
Día 2. Miércoles, 20 de marzo
Una vez que conozcamos la herramienta IPT, veremos cómo y dónde publicar un artículo de datos. A continuación, comenzaremos a trabajar con los juegos de datos particulares de cada participante.
09:00 – 11:00. De IPT al artículo de datos.
- Escribir un artículo de datos.
- ¿Qué secciones hace IPT?
- ¿Qué secciones hay que incorporar manualmente?
- Editoriales y editores
- Ejemplos de artículos
11:00 – 11:30. Pausa para café.
11:30 – 13:30. Trabajar con IPT para un conjunto de datos particular.
13:30 – 14:30. Pausa para comida.
14:30 – 16:00. Trabajar con IPT para un conjunto de datos particular. ∞Continuación∞.
16:00 – 16:30. Pausa para café.
16:30 – 17:30. Trabajar con IPT para un conjunto de datos particular. ∞Continuación∞.
Día 3. Jueves, 21 de marzo
En la última jornada del taller seguiremos los pasos para publicar un artículo de datos por cada uno de los conjuntos de datos de los participantes.
09:00 – 11:00. Publicar nuestro artículo de datos.
11:00 – 11:30. Pausa para café.
11:30 – 13:30. Cuestiones complementarias respecto a IPT.
13:30 – 14:30. Pausa para comida.
14:30 – 16:00. Aclaración de dudas. Evaluación y repaso.
16:00 – 16:30. Pausa para café.
16:30 – 17:30. Cierre del curso.
Documentos Adjuntos
Datos (primarios) de biodiversidad: ¿Por qué publicarlos? - Francisco Pando (archivo. pdf; Mb) Introducción: de la publicación de datos a la publicación de artículos científicos - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 2.3 Mb) Artículo de datos: qué es - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 1.6 Mb) Datos: licencias - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 1.4 Mb) Datos: el proceso - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 1.6 Mb) Integrated Publishing Toolkit - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 1.9 Mb) Artículo de datos - Pablo Muñoz (archivo. pdf; 3.1 Mb)Enlaces de Interés
https://pensoft.net/img/upl/file/DataPaperPoster.pdf http://discovery.ac.uk/files/pdf/Licensing_Open_Data_A_Practical_Guide.pdf https://gbif.es/datos-biodiversidad/participa-en-gbif-es/data-papers/ https://www.jstage.jst.go.jp/article/dsj/10/0/10_10-001/_pdf https://link.springer.com/article/10.1007/s12021-010-9084-8?LI=true https://www.nature.com/articles/461145a https://bioone.org/journals/bioscience/volume-60/issue-5/bio.2010.60.5.2/Open-Data-and-the-Social-Contract-of-Scientific-Publishing/10.1525/bio.2010.60.5.2.full https://essd.copernicus.org/articles/4/47/2012/essd-4-47-2012.html https://zookeys.pensoft.net/articles.php?id=2679 https://phytokeys.pensoft.net/articles.php?id=1417 https://zookeys.pensoft.net/articles.php?id=3024 https://www.gbif.org/es/termsDocumentos de Interés
01.-Por qué publicar datos primarios de biodiversidad - Francisco Pando - (Video en YouTube) 02.-De la publicación de datos a los artículos científicos - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 03.-El porqué de los artículos de datos - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 04.-Cómo publicar los artículos de datos - Pablo Muñoz - (Video YouTube) 05.-Generación de Darwin Core Archive con Darwin Test - Pablo Muñoz - (Video YouTube) 06.-Visión general de un recurso en el IPT - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 07.-Integrated Publishing Toolkit (IPT) 1ª Parte - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 08.-Integrated Publishing Toolkit (IPT) 2ª Parte - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 09.-Tipos de licencias para proteger los datos publicados - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 10.-Características y estructura del artículo de datos - Pablo Muñoz - (Video en YouTube) 11.-Repaso a las revistas de la Editorial Pensoft - Pablo Muñoz - (Video en YouTube)
Listado de Participantes
| Nº | Nombre | Organización |
|---|---|---|
| 1 | Galicia Paredes David | Universidad de Navarra. Departamento de Biología Ambiental |
| 2 | Fernández Peralta Lourdes | CENTRO OCEANOGRÁFICO DE MÁLAGA DEL INSTITUTO ESPAÑOL DE OCEANOGRAFÍA |
| 3 | Espinosa Sánchez Marta | Universidad de Extremadura, Dpto. Biología y Producción Vegetal. [Herbario] |
| 4 | Ríos López Pilar | Centro Oceanográfico de Gijón. Instituto Español de Oceanografía. |
| 5 | de la Cruz López Salvador | Universidad de La Laguna, Departamento de Biología Animal de la Universidad de La Laguna [Colección del Departamento de Biología Animal] |
| 6 | Díaz Lorca Anna | Instituto Mediterrénao de Estudios Avanzados (IMEDEA) |
| 7 | Pérez Luque Antonio Jesús | Observatorio de seguimiento de los efectos del cambio global de Sierra Nevada. Centro Andaluz de Medio Ambiente, Universidad de Granada, Junta de Andalucía. |
| 8 | Torralba Burrial Antonio | Dpto. Biología de Organismos y Sistemas, Universidad de Oviedo |
| 9 | Aguayo Becerra Daniel | Universidad de Granada. Departamento de Biología Animal [Entomología] |
| 10 | Serrano Marino José | Universidad de Murcia, Área de Biología Animal, Dpto. de Zoología y Antropología Física, Facultad de Veterinaria. [Invertebrados] |
| 11 | García Sánchez José | Universidad de Málaga, Dpto. Biología Vegetal, Fac. Ciencias. [Herbario] |
| 12 | Sempere Rodríguez María del Rosario | Estación Biológica de Doñana (CSIC) |
| 13 | García San León David | Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario] |
| 14 | Nualart Dexeus Neus | Instituto Botánico de Barcelona (CSIC - Ayuntamiento de Barcelona) [Herbario] |
| 15 | Vizoso Paz Mariate | Universidad de Granada |
| 16 | Dueñas Carazo Margarita | Real Jardín Botánico (CSIC) |
| 17 | Rey Fraile Isabel | Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) |
| 18 | Uribe Porta Francesc | Museo de Ciencias Naturales de Barcelona |
| 19 | Hernández García Francisco Javier | Universidad de Salamanca |
| 20 | López Párraga Encarnación | Universidad de Córdoba, Dpto. Biología Vegetal (Botánica) [Herbario] |