Taller GBIF.ES: Elysia, una aplicación para la gestión de colecciones de historia natural
Descripción:
Este curso está dirigido a técnicos y conservadores de colecciones de historia natural (tanto zoológicas como botánicas), que necesitan hacer una gestión completa de sus colecciones: fichado de especímenes, etiquetas, informes, transacciones tales como préstamos, intercambios, etc. Durante este taller se trabajará con Elysia, la nueva aplicación desarrollada por la Unidad de Coordinación de GBIF.ES, que nace de la fusión de Herbar y Zoorbar. Algunas de las nuevas funcionalidades que se verán durante el curso serán:
- asignación de códigos QR (Quick Response) asociados a cada registro,
- asignación de identificadores persistentes (PURLs - Persistent Uniform Resource Locator y UUIDs - Universally Unique Identifier),
- proceso de exportación de la base de datos para su publicación en Internet o visualización en Google Earth, etc.
Algunas de las nuevas funcionalidades que se verán durante el curso son:
- Asignación de identificadores persistentes (PURLs - Persistent Uniform Resource Locator y UUIDs - Universally Unique Identifier),
- Proceso de exportación de la base de datos para su publicación en Internet,
- Soporte para cumplir con el protocolo de Nagoya
Este taller se basa en los contenidos del curso realizado a finales de 2015, donde los usuarios probaron la versión beta de la aplicación. En esta ocasión se trabajará ya con una versión estable de Elysia, donde se han resuelto los errores dectectados en la sesión de control y se han incorporado las sugerencias realizadas por los usuarios.
El taller será retransmitido en directo a través del servicio de streaming del CSIC. Se puede seguir la emisión a través del siguiente enlace: http://directo.csic.es/emision/gbifes. Para el buen seguimiento de la retransmisión se recomienda:
- Utilizar Mozilla Firefox o Google Chrome
- Tener una conexión a Internet medianamente rápida
A través del twitter de GBIF España @GbifEs (https://twitter.com/GbifEs) se podrán enviar preguntas sobre la materia impartida durante el curso. La etiqueta (hashtag) para el taller será: #ELYSIA. Se hará una selección de las preguntas recibidas, que serán respondidas a lo largo de la mañana.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
- Curso gratuito
Programa
Martes 24 de mayo de 2016
Bloque 0 - Introducción
09:30 – 10:00 Bienvenida e introducción al curso. GBIF y la información primaria sobre biodiversidad
10:00 – 10:30 Visión general de la aplicación
Bloque 1 - Puesta a punto
10:30 – 11:00 Descarga e instalación de Elysia (chequeos) - Caso práctico 0
11:00 – 11:30 Pausa para café
11:30 – 12:00 Estructura y aspectos técnicos de las bases de datos.
12:00 – 12:30 Configuración general - Caso práctico 1
12:30 – 13:00 Configuración y creación de atributos - Caso práctico 2
Bloque 2 - Fichado de datos
13:00 – 13:30 Calidad en la nomenclatura y taxonomía. Presentación.
13:30 – 15:00 Pausa para comer
15:00 – 15:30 Gestión de nombres científicos - Caso práctico 3
15:30 – 16:00 Gestión de táxones - Caso práctico 4
16:00 – 16:30 Gestión de localidades - Caso práctico 5
16:30 – 17:00 Pausa para café
17:00 – 17:15 Entrada rápida y entrada normal. Presentación
17:15 – 17:30 Configuración de atributos por defecto - Caso práctico 6
17:30 – 18:00 Creación de tablas de entrada rápida - Caso práctico 7
Miércoles 25 de mayo de 2016
Bloque 2 - Fichado de datos
09:00 – 10:30 Fichado de especímenes desde entrada rápida - Caso práctico 8
10:30 – 11:00 Volcado de datos a la colección - Caso práctico 9
11:00 – 11:30 Pausa para café
11:30 – 12:00 Formulario de fichado de ejemplares (entrada normal) - Caso práctico 10
12:00 – 12:30 Formulario de ubicaciones - Caso práctico 11
12:30 – 13:00 Fichado de imágenes y links - Caso práctico 12
13:30 – 15:00 Pausa para comer
Bloque 3 - Salida de datos
15:00 – 15:30 Códigos de barras y QR
15:30 – 16:00 Los PURLs y las bases de datos en línea
16:00 – 16:30 Consultas, etiquetas y listados - Caso práctico 13
16:30 – 17:00 Pausa para café
17:00 – 17:30 Personalización de etiquetas con información de atributos - Caso práctico 14
Jueves 26 de mayo de 2016
Bloque 3 - Salida de datos (continuación)
09:30 – 10:30 Metadatos del juego de datos - Caso práctico 15
10:30 – 11:00 Exportación a Darwin Core Archive y KML (Google Earth) - Caso práctico 16
11:00 – 11:30 Pausa para café
Bloque 4 - Lotes y Consultorías
11:30 – 12:00 Lotes y Protocolo de Nagoya - Caso práctico guiado 17
12:00 – 12:30 Consultorías - Caso práctico 18
Bloque 5 - Transacciones
12:30 – 12:45 Transacciones en las colecciones: teoría
12:45 – 13:30 Préstamos - Caso práctico 19
13:30 – 15:00 Pausa para comer
15:00 – 15:30 Solicitudes - Caso práctico 20
15:30 – 16:00 Intercambios - Caso práctico 21
16:00 – 16:30 Pausa para café
16:30 - 17:00 Sugerencias, líneas de futuro y evaluación
Documentos Adjuntos
01.-GBIF y la información primaria sobre biodiversidad (Video en Youtube) 02.-Conceptos generales sobre colecciones e importancia de su digitalización (Video en Youtube) 03.-Instalación de Elysia (Video en Youtube) 04.-Problemas frecuentes con la configuración de Elysia (Video en Youtube) 05.-Configuración general de Elysia (Video en Youtube) 06.-Configuración y creación de atributos en Elysia (Video en Youtube) 07.-Gestión de nombres científicos en Elysia (Video en Youtube) 08.-Gestión de táxones en Elysia (Video en Youtube) 09.-Gestión de localidades en Elysia (Video en Youtube) 10.-Fichado de ejemplares: entrada rápida y entrada normal (Video en Youtube) 11.-Fichado de ejemplares desde entrada rápida (Video en Youtube) 12.-Volcado de datos a la colección (Video en Youtube) 13.-Fichado de ejemplares desde entrada normal (Video en Youtube) 14.-Estructura y aspectos técnicos de Elysia (Video en Youtube)Enlaces de Interés
https://gbif.es/software/elysia/Documentos de Interés
Casos prácticos GBIF y la información primaria sobre biodiversidad - Felipe Castilla (archivo.pdf; 1,7 Mb.) Conceptos generales sobre bases de datos relacionales y MS-Access - Francisco Pando (archivo.pdf; 380 Kb.) Calidad en la nomenclatura y taxonomía - Francisco Pando (archivo.pdf; 700 Kb.) Códigos de barras y QR - Francisco Pando (archivo.pdf; 700 Kb.) Protocolo de Nagoya y Elysia - Francisco Pando (archivo.pdf; 600 Kb.) Ciclo de vida de los préstamos - Francisco Pando (archivo.pdf; 600 Kb.)Listado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Martín Hernández Inés Elena | Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC) |
2 | Casañas Machín Iván | Universidad de la Laguna - Instituto Español de Oceanografía Canarias |
3 | García Manso Ángela | Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC) |
4 | Badia Boher Jaume Adrià | Institut de Biologia Evolutiva (UPF - CSIC) |
5 | Soto de Matos-Pita Susana | Universidad de Vigo |
6 | Llana Jiménez Guillermo | Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC) |
7 | Fernández Perales Ricardo | Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC) |
8 | de Sosa Carrasco Irene | Universidad Complutense de Madrid |
9 | Jurado Güeto Silvia | Universidad de Córdoba |
10 | Londoño Gutiérrez Nelson | Universidad del Quindío (Colombia) / Universidad de Granada |
11 | Rodriguez Estela Elizabeth | CICyTTP-CONICET. Argentina |
12 | Valdeón Vélez Aitor | Universidad de Zaragoza |
13 | Fuentetaja Casado María del Pilar | CSIC-Estación Experimental de Zonas Áridas |
14 | Fernández Peralta Lourdes | CENTRO OCEANOGRÁFICO DE MÁLAGA DEL INSTITUTO ESPAÑOL DE OCEANOGRAFÍA |
15 | Ponce María Jimena | Museo Botánico de Córdoba |
16 | Fabado Alós Francisco Javier | Universidad de Valencia-Jardín Botánico |
17 | García Sánchez José | Universidad de Málaga, Dpto. Biología Vegetal, Fac. Ciencias. [Herbario] |
18 | Álvarez Dorda Beatriz | Museo Nacional de Ciencias Naturales CSIC |
19 | París García Mercedes | Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) |
20 | Riera Vicent Jesús | Jardí Botànic de la Universitat de València |
21 | Garvía Rodríguez Ángel Luis | Museo Nacional de Ciencias Naturales CSIC |
22 | Hernández García Francisco Javier | Universidad de Salamanca |