III Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Descripción
Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.
El taller es parte del programa de cursos de especialización del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que extenderá un certificado de aprovechamiento del mismo para aquellos/as alumnos/as que superen los objetivos marcados.
Metodología
El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídeo tutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 7 de septiembre de 2020.
- Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 11 de septiembre de 2020.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 16 de septiembre de 2020*.
Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM. Si existen estudiantes del curso que trabajen en entornos Linux o Mac, rogamos contactar con los docentes (jano@rjb.csic.es) para facilitar las instrucciones de cómo instalar los programas R y Rstudio en sus plataformas.
Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo, puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO
- Presentación del profesorado.
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
Módulo 1: INTRODUCCIÓN
- Qué es R.
- Instalación de R.
- Instalación de R Studio.
- Partes de R: consola y primeros comandos.
- Funciones y objetos en R.
- Partes de R Studio.
- Optimización de R Studio.
- Bajada de paquetes.
- Otras herramientas GUI.
Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS
- Uso de carpetas y ubicaciones.
- Creación de ficheros y objetos.
- Empezar con el caso de estudio.
Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS
- Introducción a los tipos de datos y estructuras.
- Vectores y operaciones con vectores.
- Matrices.
- Marcos de datos.
- Listas y arrays.
- Operaciones con texto.
- Otros tipos.
Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS
- Operaciones básicas para conocer los objetos.
- Operaciones de un tipo de dato a otro.
- Transformación en marcos de datos.
- Innovaciones en R (tidyverse).
- Optimización del código mediante el tidyverse.
Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS
- Gráficos del paquete básico.
- Otras operaciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 6: GGPLOT
- Filosofía de ggplot.
- Operaciones básicas de ggplot.
- Boxplots.
- Histogramas y densidad.
- Scatterplots.
- Barras, etc.
- Trucos.
- Leyendas, etiquetas, posiciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE
- Introducción a la programación y justificación.
- Bucles for.
- Bucles while.
- Condicionales if else.
- Resolviendo problemas de las simulaciones.
- Creación de funciones I.
- Creación de funciones II.
- Funciones de la familia apply.
Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS
- Ayuda de R.
- Stack overflow.
- GitHub.
Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R
- Introducción a R markdown.
- Generación de trozos de código.
- Operar con imágenes.
- Operar con tablas.
- Operar con índices.
- Otros tipos.
Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA
- Visión general de la estadísitca en R.
- Primeros pasos de la estadística básica en R.
- Distribuciones.
- Obtención de algunos parámetros de los modelos.
- Estadística no paramétrica.
- Introducción a modelos más complejos.
- Ejercicio guiado.
#tallerRonline2020
Ver más en twitterListado de Participantes
| Nº | Nombre | Organización |
|---|---|---|
| 1 | Etxeberria Okariz Mikel | Aranzadi Zientzia Elkartea |
| 2 | Noguera Urbano Elkin Alexi | Instituto Humboldt (Colombia) |
| 3 | Mejía Fontecha Ingrith Yuliany | Centro de Museos de la Universidad de Caldas (Colombia) |
| 4 | Montesinos Aracil Mauro | Red Eléctrica de España |
| 5 | Álvarez Enríquez Borja | Red Eléctrica de España |
| 6 | Gutiérrez Martín Iris | Parques Naturales de la C. Valenciana |
| 7 | Vitales Serrano Daniel | Instituto Botánico de Barcelona (IBB-CSIC) |
| 8 | Gallardo Beltrán Marta | Universidad de Murcia |
| 9 | Orejas Aja Patricia | Brinzal |
| 10 | Plateros Gastelum Pedro Antonio | Colegio de Postgraduados (México) |
| 11 | Chávez-Andrade Mariana | CIIDIR-Oaxaca (México) |
| 12 | García Álvarez Salvia | Fundación Conde del Valle de Salazar - Universidad Politécnica de Madrid |
| 13 | Pascual López Susana | INIA |
| 14 | Unzurrunzaga Campoy José María | Demarcación Costas Murcia (MITERD) |
| 15 | Núñez García Belén | Universidad de Extremadura |
| 16 | Isabel Rufo Jorge Miguel | Universidad de Castilla-La Mancha |
| 17 | Frank Comas Aida | Universitat de les Illes Balears |
| 18 | Delaloye Michelle | Museo de La Plata, Facultad de Ciencias Naturales y Museo (Argentina) |
| 19 | Nebreda Trejo Aaron | SEO/BirdLife |
| 20 | Padrón Mederos Miguel Antonio | Universidad de La Laguna |
| 21 | García Sánchez-Colomer Manuel Ramón | CEDEX |
| 22 | Ayres César | Asociación Herpetológica Española (AHE-Galicia) |
| 23 | Martínez Sagarra Gloria | Universidad de Córdoba |
| 24 | Casanovas Francés Pilar | Generalitat de Catalunya |
| 25 | Recasens Marc Anton | Institut Català d'Ornitologia (ICO) |
| 26 | Casañas Machín Iván | Instituto Español de Oceanografía - C.O. Tenerife |
| 27 | Montero Muñoz Iris | Universidad Autónoma de Madrid |
| 28 | Plos Anabela | GBIF Argenitna |
| 29 | Cabrero Sañudo Francisco José | Universidad Complutense de Madrid |
| 30 | Fernández Peralta Lourdes | Instituto Español de Oceanografía - C.O. Málaga |
| 31 | Larumbe Arricibita Jokin | Gobierno de Navarra |
| 32 | Chic Giménez Oscar | Institut de Ciències del Mar (ICM-CSIC) |
| 33 | Pino Pérez Juan José | Asociación BIGA |
| 34 | Mateos Cordero Marco Antonio | REDIAM. Agencia de Medio Ambiente y Agua de Andalucía. Consejería de Agricultura, Ganadería, Pesca y Desarrollo Sostenible. Junta de Andalucía |
| 35 | Sanz Trullén Víctor Manuel | Gobierno de Aragón |
| 36 | Cires Rodríguez Eduardo | Universidad de Oviedo |
| 37 | Peña Freire Viviana | Universidade da Coruña |
| 38 | Álvarez Fernández Inés | Real Jardín Botánico (RJB-CSIC) |
| 39 | Carrió González Elena | Universidad Politécnica de Madrid |
| 40 | Vicens-Fornés Magdalena | Jardí Botànic de Sóller |
| 41 | Montagud Alario Sergio | Universitat de València |