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Descripción: Curso introductorio a VegAna (Vegetation edition and Analysis). Se trata de un paquete integrado de programas destinado a la gestión y

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Taller
Tipo

Presencial

Fecha comienzo Taller

21/12/2009

Lugar

Aula de Informática del Real Jardín Botánico (CSIC) de Madrid. Edificio de Investigación. C/ Claudio Moyano 1

A cargo de

Xavier Font (Universidad de Barcelona) y Nora P&eacuterez (Universidad de Barcelona)

Idioma

Castellano

Contacto

info@gbif.es

Introducción al programa VegAna para la gestión y análisis de datos florísticos y ecológicos

Descripción:

Curso introductorio a VegAna (Vegetation edition and Analysis). Se trata de un paquete integrado de programas destinado a la gestión y análisis de datos ecológicos en general y muy especialmente de vegetación. Contiene 4 programas principales entrelazados:

  • Ginkgo: orientado a la representación y clasificación de individuos a partir de datos multivariantes.
  • Quercus: es un editor de tablas de datos de tipo inventario. Permite la introducción y gestión de inventarios de especies.
  • Fagus: Es un editor y gestor de citas florísticas. Se pueden almacenar datos inéditos, bibliográficos y de colecciones.
  • Yucca: Permite la representación cartográfica de los datos, principalmente distribuciones de taxones y grupos de áreas.

Podrá encontrar más información en: http://biodiver.bio.ub.es/vegana, donde se encuentran también las instrucciones de uso de cada programa.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
  • Orden de inscripción.

Programa

Lunes  21 de diciembre de 2009

9:30 - 11:00

Bienvenida e introducción al curso

GBIF e información primaria sobre biodiversidad

Generalidades: Visión general del proyecto VegAna. Instalación de los módulos y prerrequisitos del sistema. Ficheros de un proyecto de trabajo, configuración, descarga y actualización de tesauros (taxonómicos y sintaxonómicos).

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

Módulo Fagus: Introducción de citas florísticas (observaciones de campo, pliegos de herbario y citas bibliográficas), importación de datos TXT y XML (Anthos, BDBC, BioCase y GBIF).

13:30 - 15:00. Pausa comida.

15:00 - 17:00

Módulo Zamia: Instalación del programa en una PDA conexión con un GPS. Demostración de la toma de datos (observaciones e inventarios) en el campo (Jardín Botánico).

Módulo Yucca: Importación de mapas y calibrado de imágenes cartográficas. Uso de capas WMS. Elaboración de mapas de distribución.

17:00 - 17:20 Pausa para café

17:20 - 19:00.

Módulo Fagus: Edición de tesauros. Impresión de etiquetas, elaboración de floras y documentos. Elaboración y análisis de datos. Cartografía de especies.

Martes 22 de diciembre de 2009

9:00 - 11:00

Módulo Quercus: Informatización de inventarios de vegetación. Importación de inventarios en formato xml (BDBC y SIVIM). Edición de tablas de inventarios y tablas sintéticas. Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

Módulo Quercus: Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.

13:30 - 15:00. Pausa comida.

15:00 - 17.00

Módulo Ginkgo: Importación/exportación de datos. Cálculo de índices de similaridad/disimilaridad.Introducción al análisis multivariante de datos. Métodos de ordenación (PCA, PcoA y CA) y métodos de clasificación jerárquicos y no jerárquicos (K-means y Fuzzy C-means. Estudio de la fidelidad de las especies a las comunidades.

17:00 - 17:30

Evaluación, aclaración de dudas y cierre del curso.

Documentos Adjuntos

Vídeos del taller

Enlaces de Interés

http://biodiver.bio.ub.es/vegana/castellano/index.html

Documentos de Interés

Proyecto Fagus empaquetado Presentación http://biodiver.bio.ub.es/FontMaster2008/UTM-Catalunya.txt Var. ambientales Cataluña Fidelidad Modelo de tesauro a importar a Vegana K-means Formato importación de tablas

Listado de Participantes

Nº Nombre Organización
1 Garófano Gómez Virginia
2 Laguna Defior Clara
3 Galicia Herbada David
4 de la Torre Llorente Daniel
5 Rodríguez García Alberto
6 Hernández Palacios Gonzalo
7 Rodríguez Rojo María Pilar
8 Prieto Amador
9 Fernández Calzado Mª Rosa
10 Errea Abad Maria Paz
11 Fernández Fernández Juan Gabriel
12 Rubio Teso María Luisa
13 Chacón Labella Julia
14 Castillejo Moreno José Miguel
15 González Oreja José Antonio
16 López González Beatriz
17 Lado Rodríguez Carlos MYXOTROPIC. Myxobiota Neotropical. Estudio biosistemático de Myxomycetes de las zonas áridas
18 García San León David Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario]
19 Ibáñez Gastón Ricardo Universidad de Navarra. Departamento de Biología Ambiental