Descripción
Este taller teórico-práctico está dirigido principalmente a desarrolladores de Nodos de GBIF que utilizan el modelo del Atlas of Living Australia (ALA) como portal de datos de biodiversidad nacional y a desarrolladores que tienen interés en empezar a utilizar esta tecnología. El objetivo del taller es compartir el conocimiento y las experiencias de este conjunto de herramientas de código abierto y fortalecer la comunidad que se ha creado en torno a los diferentes países que utilizan ALA. En el taller se estudiará el conjunto principal de componentes que integran el Atlas e incluirá información sobre actualizaciones y nuevas características.
Este taller de 5 días será impartido por instructores de Atlas of Living Australia (David Martin y Nick Dos Remedios), GBIF Francia (Marie-Elise Lecoq) y GBIF España (Santiago Martínez de la Riva). El taller está financiado con fondos del programa CESP (Capacity Enhancement Support Programme) de GBIF.
Atlas of Living Australia (ALA) proporciona acceso gratuito en línea a información sobre la biodiversidad de Australia. Es una infraestructura colaborativa y abierta que reúne datos de biodiversidad de múltiples fuentes y los hace accesibles y reutilizables. El ALA se utiliza para actividades de investigación, monitoreo ambiental, planificación y gestión de la conservación, educación y ciencia ciudadana. Al tratarse de una plataforma de código abierto, muchos otros países, en su mayoría miembros de la red de GBIF, han optado por reutilizar esta tecnología y adaptarla a sus contextos nacionales. España, Francia, Portugal, Argentina, Estonia, Brasil, Reino Unido, son solo algunos ejemplos donde se utiliza ALA como portal de datos de información en biodiversidad.
Información técnica
El taller estará compuesto de presentaciones y sesiones prácticas. En las sesiones prácticas, usaremos un servidor virtual alojado en la nube. Se recomienda a los participantes traer su ordenador portátil con los siguientes programas instalados:- Linux o Mac OSX. En caso de tener Windows, se recomienda instalar previamente VirtualBox.
- Ansible 2.
- Java 8.
- Grails (usando http://sdkman.io/).
- Oracle's VirtualBox & Vagrant.
- Un editor de textos.
- Algún Entorno de Desarrollo Integrado (IDE, por sus siglas en inglés). Recomendamos Intellij pero Eclipse también puede ser válido.
Información logística
Mapa de ubicación y otros lugares de interés: https://goo.gl/shkRC3-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
Lunes 19 feb (mañana) - INTRODUCCIÓN Y PRESENTACIONES INICIALES
- 9:00 Bienvenida.
- 9:15 Breve introducción de los participantes - 1 o 2 diapositivas.
- 10:00 Introducción al Atlas of Living Australia.
- 10:30 Pausa café.
- 11:00 Explicación sobre la comunidad de los Living Atlases.
- 11:30 Introducción a la estructura: Montando un Living Atlas en tu nodo de biodiversidad.
- 12:00 Introducción a Ansible.
- 12:30 La Estructura Modelo.
- 13:00 Comida.
Lunes 19 feb (tarde) - INSTALACIONES DE DEMOSTRACIONES
- 14:00 Práctica - Amazon EC2 VMs para formación - ver ejercicios más abajo.
- 15:30 Pausa café.
- 16:00 Práctica - Repaso/Resumen.
- 17:00 Fin de la primera jornada.
Martes 20 feb (mañana) - NUEVA FUNCIONALIDAD DEL ALA & LIVING ATLASES
- 9:00 Centros de datos - apoyando el co-desarrollo entre los diferentes nodos GBIF.
- 9:30 Descarga de DOIs.
- 10:00 Publicando en GBIF a través del Registro (collectory).
- 10:30 Pausa café.
- 11:00 Otros desarrollos nuevos - espacio para que los participantes hablen de manera opcional sobre un proyecto.
- Herramientas de Ciencia Ciudadana.
- Estonia - charla sobre datos moleculares.
- Editando un perfil taxonómico.
- El nuevo portal espacial.
- Otras actualizaciones de componentes existentes (biocache-hub, collectory).
- Trabajos de desarrollo planificado de ALA.
- 13:00 Comida.
Martes 20 feb (tarde) - UTILIZACIÓN DE TU PROPIA TAXONOMÍA CON ATLAS
- 14:00 Índice de nombres & estructura DwCA para taxonomía.
- 14:30 Práctica - Uso de la estructura de GBIF o del Catalogo de la Vida.
- 15:00 Utilización de tu propia taxonomía.
- 17:00 Fin de la segunda jornada.
Miércoles 21 feb (mañana) - PERSONALIZACIÓN Y CONTRIBUCIÓN AL CÓDIGO FUENTE
- 9:00 Introducción a Github.
- 10:00 Obteniendo tus códigos modificados en Github.
- 10:30 Pausa café.
- 11:00 Documentación.
- 11:15 Introducción a Grails.
- 12:00 Ejercicios.
- 13:00 Comida.
Miércoles 21 feb (tarde) - PERSONALIZACIÓN DE COMPONENTES
- 14:00 Práctica - Ejercicios.
- 15:30 Pausa café.
- 16:00 Ejercicios.
- 17:00 Fin de la tercera jornada.
- 20:30 Cena "Oficial".
Jueves 22 feb (mañana) - COMPONENTES ESPACIALES
- 9:00 ALA4R.
- 9:30 Estructura de los componentes espaciales.
- 10:00 Explicación de capas.
- 10:30 Pausa café.
- 11:00 Uso de la imagen EC2 del portal espacial (en preparación).
- 13:00 Comida.
Jueves 22 feb (tarde) - EJECUCIÓN DEL PORTAL SPACIAL
- 14:00 Ejercicios.
- 15:30 Pausa café.
- 16:00 Ejercicios.
- 17:00 Fin de la cuarta jornada.
- 17:30 Visita guiada gratuita al Museo del Prado (opcional).
Viernes 23 feb (mañana) - PÁGINAS Y LISTAS DE ESPECIES
- 9:00 Estructura de BIE - páginas de especies e índices de búsqueda.
- 10:00 Listas - características, listas de conservación, etc.
- 10:30 Pausa café.
- 11:00 Ejercicios.
- 13:00 Comida.
Viernes 23 feb (tarde) - FUTURO DE LA COMUNIDAD ALA
- 14:00 Discusión: ¿cómo mantener a la comunidad ALA en las futuras convocatorias de proyectos y talleres, además de implicar a más países/organizaciones que quieran usar ALA y apoyar nuevos desarrollos?
- 15:00 Puntos de acción y evaluación.
- 15:30 Pausa café.
- 16:00 Discusión.
- 17:00 Fin del taller.
*Para las sesiones prácticas, los participantes se organizarán en grupos de 2 o 3 desarrolladores que trabajarán juntos con una máquina virtual. Los detalles sobre el acceso a estas máquinas se proporcionarán durante el taller.
#ALAWorkshopMadrid
Ver más en BlueSkyDocumentos Adjuntos
Presentación de los participantesDocumentos de Interés
Página del proyecto CESP en GBIF.ORG Líneas de actuación (sólo en inglés) Fotos del taller
Listado de Participantes
| Nº | Nombre | Organización |
|---|---|---|
| 1 | Atlas of Living Australia | |
| 2 | Batista-Navarro Riza | University of Manchester / Philippines |
| 3 | Blissett Matthew | GBIF Secretariat |
| 4 | Cavière Fabien | GBIF France |
| 5 | Figueira Rui | GBIF Portugal |
| 6 | Galvez Contreras Abner Andrés | GBIF Chile. Ministerio del Medio Ambiente de Chile |
| 7 | Goimard Jérémy | Canadensys |
| 8 | Grant Sharon | The Field Museum of Natural History - US |
| 9 | Holetschek Jörg | GBIF Germany |
| 10 | Ko Chihjen | Taiwan Biodiversity Information Facility |
| 11 | Koura Kourouma | GBIF Benin |
| 12 | Lecoq Marie-Elise | GBIF France |
| 13 | Martin David | Atlas of Living Australia |
| 14 | Martínez de la Riva Santiago | GBIF Spain |
| 15 | Ouboter Dimitri Alexander | National Zoological Collection of Suriname. Anton de Kom University of Suriname |
| 16 | Quijano Jr. Brandito M. | University of the Philippines Diliman |
| 17 | Radcliff Sophie | National Biodiversity Network (NBN). United Kingdom |
| 18 | Ramírez Lorca Jaime Nahuel | GBIF Argentina |
| 19 | Roberts Reuben | National Biodiversity Network (NBN). United Kingdom |
| 20 | Shah Manash | GBIF Sweden |
| 21 | Shashkov Maxim | Institute of Mathematical Problems of Biology, Russia |
| 22 | Vargas Manuel | Instituto Nacional de Biodiversidad - Costa Rica |
| 23 | Zhao Xiaoqian | National Specimen Information Infrastructure of China (NSII) - China |
| 24 | Zirk Allan | GBIF Estonia |