Taller online GBIF.ES: Estandarización y publicación de datos de biodiversidad de regiones polares
Descripción
Este taller teórico-práctico tiene como objetivo mejorar la capacidad de los participantes para preparar y publicar datos de biodiversidad utilizando como hilo conductor los procedimientos y portales de GBIF. Se abordarán aspectos relativos a la calidad, limpieza y depuración de los datos, estandarización y publicación a través de la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT), así como la preparación de manuscritos para la publicación de data papers. El taller está organizado por GBIF.ES en colaboración con las PTI del CSIC POLARCSIC y ECOBIODIV, y está especialmente dirigido a investigadores/as que manejan datos tomados en las regiones polares.Metodología
El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (https://elearning.gbif.es/). Los contenidos del curso serán una combinación de vídeos, presentaciones y casos prácticos. Se estima que el tiempo necesario para completar el curso es equivalente a 30 horas lectivas, que se podrán repartir de manera libre a lo largo de las dos semanas de duración del curso. Los participantes podrán interaccionar con los docentes y el resto de participantes a través del foro de la plataforma e-learning.Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 9 de abril de 2021.
- Publicación de lista de alumnos/as en la página web del taller el 16 de abril de 2021.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Manejo de datos potencialmente publicables en GBIF.
- Que el ámbito geográfico de los juegos de datos sea las zonas polares.
- Capacidad de difusión de los contenidos del taller.
- Adscripción a una institución/instituto que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- En el taller se manejarán archivos .csv y .txt.
- Es recomendable tener un juego de datos propio para realizar algunos de los casos prácticos del taller.
- Al registrarse se podrá hacer como oyente (acceso a materiales pero no interacción con docentes y resto de participantes, no corrección de ejercicios, no certificado) o como participante.
- Próximamente se abrirá la convocatoria de otro taller de publicación de datos de biodiversidad dirigido a investigadores en ecología que son miembros de la red LTER España.
-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
MÓDULO 0: INTRODUCCIÓN
- Ciencia, datos, resultados e infraestructuras - Francisco Pando (GBIF.ES)
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad - Cristina Villaverde (GBIF.ES)
MÓDULO 1: CONCEPTOS GENERALES
Introducción a la publicación de datos de biodiversidad - Katia Cezón (GBIF.ES) / Dairo Escobar (SiB Colombia)
Flujo general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF - Katia Cezón (GBIF.ES)
MÓDULO 2: ESTANDARIZACIÓN Y PREPARACIÓN DE LOS DATOS PARA SU PUBLICACIÓN
Estándares - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires/Vertnet) y Katia Cezón (GBIF.ES)
- Conceptos de estándares: tipos, vocabularios, fuentes
- Estándar Darwin Core
- Extensiones Darwin Core
- Darwin Core Archive
- Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit)
Caso práctico 01 - Adaptación al estándar Darwin Core
Conceptos básicos de la calidad y limpieza de datos de biodiversidad (definiciones y aspectos teóricos importantes) - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires/Vertnet) y Katia Cezón (GBIF.ES)
Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)
Prácticas con herramientas para la limpieza y control de la calidad de los datos
- Caso práctico 02 - Herramientas para la gestión de nombres científicos - Species Matching
- Caso práctico 03 - Herramientas para la gestión de nombres científicos - Name Parser
- Caso práctico 04 - Herramientas para el tratamiento de las fechas
- Caso práctico 05 - Herramientas para la conversión de coordenadas
- Caso práctico 06 - Herramientas para la validación de datos - Validador de datos de GBIF
MÓDULO 3: PUBLICACIÓN DE DATOS EN EL SISTEMA DE GBIF
Licencias de Uso de los Datos - Francisco Pando
Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit) como herramienta de publicación y ejemplo guiado - Katia Cezón (GBIF.ES)
Caso práctico 07 - Prácticas de publicación a través del IPT con datos de ejemplo
- Prácticas de publicación con juegos de datos de tipo registros de presencia, evento de muestreo y checklist.
- Prácticas de publicación avanzada (mediante el uso de extensiones de información para complementar la información anterior).
Caso práctico 08 - Prácticas de publicación a través del IPT con datos propios
¿Cómo se verán los datos una vez publicados? Portales de GBIF.org y datos.gbif.es - Cristina Villaverde (GBIF.ES)
MÓDULO 4: PUBLICACIÓN DE ARTÍCULOS DE DATOS (“DATA PAPERS”)
Introducción a los data papers: qué son y por qué publicarlos - David Galicia (Univ. Navarra) y Nora Escribano (Univ. Navarra)
- Costes asociados a la generación de un recurso - David Galicia (Univ. Navarra)
- Incentivos para la publicación de datos - David Galicia (Univ. Navarra)
- Objetivo y estructura de un data paper - David Galicia (Univ. Navarra)
- Plataforma ARPHA - Nora Escribano (Univ. Navarra)
Caso práctico 09: elaboración de un data paper con la herramienta online Arpha.
Evaluación del curso.
#tallerGBIFDatosPolares
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Vídeos de los contenidos del tallerListado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Ramírez Francisco | Instituto de Ciencias del Mar - CSIC |
2 | Bertoglio Florencia | IIBCE (Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable), Uruguay |
3 | De Feo Bárbara | Centro Universitario Regional del Este (CURE), Uruguay |
4 | Krojmal Fernández Evelyn | Centro Universitario Regional del Este (CURE), Uruguay |
5 | Arteaga Bengoa Álvaro Martín | Universidad Científica del Sur, Perú |
6 | Cóndor Luján Báslavi Marisbel | Universidad Científica del Sur, Perú |
7 | Nole Maryuri | INGEMMET, Perú |
8 | Cerpa Luis | INGEMMET, Perú |
9 | Moreno Leveroni Bernabé | Universidad Científica del Sur, Perú |
10 | Morano Büchner Susana Javiera | Instituto de la Patagonia, Universidad de Magallanes, Chile |
11 | Barreto Tabaré | Museo Municipal Virginia Choquintel, Argentina |
12 | Serrano Timonet Diana | IMAR |
13 | Silva María Regina | Museo del Fin del Mundo, Argentina |
14 | Indacochea Mejía Aldo Gonzalo | Universidad Científica del Sur, Lima, Perú |
15 | Rodríguez Pérez Esther | Museo Nacional de Ciencias Naturales - CSIC |
16 | Dorado Roncancio Fernando | |
17 | Coitiño Banquero Hugo Ignacio | Ministerio de Ambiente y ECOBIO Uruguay |
18 | Cedeño Posso Cristina María | Instituto de investigaciones Marinas y Costeras INVEMAR, Colombia |
19 | Polo Sánchez Antonio | GEO3BCN - CSIC |
20 | Sparaventi Erica | Instituto de Ciencias Marinas de Andalucía (ICMAN-CSIC) |
21 | Morales Ocaña Cecilia | Instituto Andaluz de Ciencias de la Tierra - Geociencias Marinas |
22 | Jiménez Espejo Francsico José | Instituto Andaluz de Ciencias de la Tierra |
23 | Coll Monton Marta | Instituto de Ciencias del Mar - CSIC |
24 | López de Alda Miren | Instituto de Diagnóstico Ambiental y Estudios del Agua - CSIC-CSIC |
25 | López Llorens Javier | Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Montes, Forestal y del Medio Natural. Universidad Politécnica de Madrid |
26 | Montes Moreno Noemí | Institut Botànic de Barcelona, Herbario BC |
27 | Cires Rodríguez Eduardo | Universidad de Oviedo |
28 | Barbosa Alcón Andrés | Museo de Ciencias Naturales - CSIC |