I Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad
Descripción:
Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.
Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.
Los alumnos podrán aportar sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
- Orden de inscripción.
Con la colaboración de: CRIA y Universidad de Navarra.
Programa
PARTE I: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES EN INTERNET
Construcción de un sistema de gestión y publicación de imágenes digitales.
- Obtención de la imagen digital.
- Tratamiento posterior de las imágenes.
- Diseño e implementación de bancos de datos asociados.
- Diseño e implementación de interfaces.
Interrelación con otros sistemas de información biológica.
Algunas iniciativas existentes.
- Flora brasiliensis (Centro de Referência em Informação Ambiental, Brasil).
- Otros ejemplos destacados.
Tecnologías de almacenamiento y gestión de imágenes.
- Servidores de imágenes.
- Repositorios de archivos.
Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
PARTE II: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL
Fundamentos de la imagen digital.
- Óptica y Física de la formación de la imagen.
- Tecnología de los sensores de imagen.
- Sistemas y formatos de almacenamiento y transferencia.
Técnicas de captura.
- Preparación física de los objetos.
- Integración de sistemas ópticos y fotográficos.
- Técnicas de iluminación.
- Adquisición de la imagen: casuística.
- Imágenes planares: herbarios.
- Imágenes tridimensionales: especímenes de gran tamaño.
- Macrofotografía.
- Microfotografía.
- Imagen morfométrica.
Post-procesado de la imagen.
- Retoque y modificación.
- Automontaje.
- Morfometría.
Problemas en imagen digital.
- Precisión espacial, escalas y paralaje.
- Distorsión y aberración.
- Fidelidad cromática.
- Metadatos y gestión de archivos.
NOTA: El taller se impartirá en sesiones de mañana y tarde, de 9:00 a 18:30h.
Links of Interest
http://www.zoomify.com/ http://www.gimp.org.es/ https://combinezm.en.lo4d.com/windows https://imagej.nih.gov/ij/ https://www.irfanview.com/ http://www.cerious.com/ https://www.gbif.org/document/80576/digital-imaging-of-biological-type-specimens-a-manual-of-best-practice http://florabrasiliensis.cria.org.br/ https://www.unav.edu/web/museo-de-cienciasDocuments of Interest
El proceso de publicación de imágenes digitales en Internet, Sidnei de Souza (fichero .PPT, 17.3 Mb). Práctica con un servidor de imágenes y metadatos, Sidnei de Souza (.PDF, 561 Kb). Práctica con un visor de imágenes en web, Silvia Lusa Bernal (.PDF, 224 Kb).
List of participants
| Nº | Name | Organization |
|---|---|---|
| 1 | Cardiel Sanz José María | Universidad Autónoma de Madrid. Departamento de Biología. Área de Botánica. |
| 2 | Picazo Mota Félix | Universidad de Murcia |
| 3 | Ibáñez Cortina Neus | Instituto Botánico de Barcelona (CSIC - Ayuntamiento de Barcelona) [Herbario] |
| 4 | López Hernández Heriberto D. | Universidad de La Laguna |
| 5 | López Chaparro José Luis | Junta de Extremadura |
| 6 | Sesma Moranas José Manuel | Insectarium virtual |
| 7 | Agulló Villaronga Jordi | Museo de Ciencias Naturales de Barcelona (MCNB) |
| 8 | Gutiérrez Esteban María | Junta de Extremadura |
| 9 | Lado Rodríguez Carlos | MYXOTROPIC. Myxobiota Neotropical. Estudio biosistemático de Myxomycetes de las zonas áridas |
| 10 | Muñoz Fuente Jesús | CSIC-Real Jardín Botánico |
| 11 | Sánchez Ruiz Manuel | Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC, Madrid) |
| 12 | París García Mercedes | Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC) |
| 13 | Noya Santos Rosario | CSIC-Real Jardín Botánico |
| 14 | García San León David | Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario] |
| 15 | Riera Vicent Jesús | Jardín Botánico de Valencia |
| 16 | Garzón García Julia | Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva (Valencia) |
| 17 | Vizoso Paz Mariate | Universidad de Granada, Servicio de Herbario de la Universidad de Granada [Herbario] |
| 18 | Quesada Ochoa Carmen | Universidad de Granada, Servicio de Herbario de la Universidad de Granada [Herbario] |
| 19 | Dueñas Carazo Margarita | Real Jardín Botánico (CSIC) |
| 20 | Martínez Laborde Juan Bautista | Universidad Politécnica de Madrid |
| 21 | Fernández Blanco Luis Miguel | Universidad de León, Colecciones Zoológicas (CZULE) [Colecciones zoológicas] |
| 22 | Gil Borrell Paloma | Universidad Politécnica de Madrid, Dpto. Silvopascicultura (Botánica), E.T.S.I. Montes. [Herbario] |
| 23 | Martín-Consuegra Fernández Enriqueta | Jardín Botánico de Córdoba |
| 24 | Hernández-Corral Jesús | TAFAE (Asociación para la defensa del Medio Ambiente) |