Gbif.es » Formación y divulgación » II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank
Workshop
Type

Presencial

Workshop start date

13/06/2023

Workshop end date

14/06/2023

Place

Aula de informática del CSIC

Address

c/ Joaquín Costa, 22.

How to get

Link Google Maps

Trainers

Yolanda Jiménez Ruiz, Brent Emerson, David García San León, Francisco Pando, Gloria Martínez

Language

English

Maximum number of participants

20

Estimated duration

10

II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank

Descripción: El avance de los estudios de biodiversidad de la mano de las técnicas moleculares y nuevos enfoques ecológicos en tiempos recientes ha sido espectacular. Sin embargo, la falta de procedimientos y prácticas para hacer las conclusiones de estos estudios revisables pone en cuestión su solidez y validez científica en muchos casos. En este contexto, la importancia de los ejemplares de colecciones como pilar del método científico en estos estudios es cada vez más reconocida y aceptada. Esta situación es una oportunidad para las colecciones, si al publicar sus datos en línea se hace con enlaces al  GenBank y si se colabora con los repositorios de GenBank para que desde estos se enlace a los ejemplares de respaldo. Cómo hacerlo es el objeto de este taller. Pasos a seguir para matricularse: Rellenar el formulario de inscripción hasta el 9 de mayo de 2023. La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 22 de mayo de 2023*. Publicación de la lista de alumnos en la página web del taller el 29 de mayo de 2023. *Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente. Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos: Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF. Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución. Conocimientos sobre la materia. Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática. Orden de inscripción.

Programa

Martes 13 de junio de 2023

09:30 - 10:00

  • Bienvenida e introducción al curso
  • GBIF y la información primaria sobre biodiversidad

10:00 - 11:00

  • Qué es el GenBank

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

  • El papel de las colecciones de historia natural en los estudios moleculares - Yolanda Jiménez Ruiz
  • La iniciativa "Barcode of Life" y las colecciones - Brent Emerson

13:30 - 15:00 Pausa comida

15:00 - 17:00 (30' para café)

  • Implicaciones para las colecciones. Muestreos destructivos
    • Principios generales y colecciones botánicas
    • Aspectos específicos de las colecciones zoológicas
  • Experiencias previas
  • Debate: el tema de los materiales testigo, su citación: buenas y malas prácticas

Miércoles 14 de junio de 2023

9:30 - 11:00

  • Las bases de datos del GenBank (presentación estructura, información que contiene, identificadores)
  • Cómo tratar la información molecular en las colecciones de HN y sus implicaciones en los procedimientos de trabajo y sus bases de datos

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:00

  • Cómo colaborar con GenBank para enlazar la información de las secuencias con las bases de datos en línea de las colecciones

13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del taller

 

- evento realizado, materiales disponibles -

tallerBasesDatosColeccionesGenBank2023

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List of participants

Name Organization
1 Casas Castaño Laura Instituto de Investigaciones Marinas (IIM-CSIC)
2 Muñoz Colmenares Manuel Eduardo Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva
3 García González Francisco José TRAGSATEC
4 Paredero García Manuel César IRNASA - CSIC
5 Rodríguez Fernández Sergio Universidad de León
6 López Llorens Javier Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Montes, Forestal y del Medio Natural (ETSMFMN) (UPM)
7 Alté García-Olías Luis Real Jardín Botánico - CSIC
8 Sánchez Vialas Alberto MNCN - CSIC
9 Buira Clua Antoni Real Jardín Botánico - CSIC
10 de la Cruz Calleja Ana Carmen INIA - CSIC
11 Calvo Revuelta Marta MNCN - CSIC
12 Alfaro Saiz Estrella Herbario LEB. UNILEON
13 Cabrero Sañudo Francisco José Museo de Entomología UCME - Universidad Complutense de Madrid
14 Muñoz de los Reyes Isabel Centro Oceanográfico de Cádiz, IEO - CSIC
15 Pascual Alayón Pedro José Instituto Español de Oceanografía