II Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Descripción
Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.
El taller es parte del programa de cursos de especialización del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que extenderá un certificado de aprovechamiento del mismo para aquellos/as alumnos/as que superen los objetivos marcados.
Metodología
El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídeo tutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 10 de septiembre de 2019.
- Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 13 de septiembre de 2019.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 17 de septiembre de 2019*.
Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM. Si existen estudiantes del curso que trabajen en entornos Linux o Mac, rogamos contactar con los docentes (jano@rjb.csic.es) para facilitar las instrucciones de cómo instalar los programas R y Rstudio en sus plataformas.
Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo, puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO
- Presentación del profesorado.
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
Módulo 1: INTRODUCCIÓN
- Qué es R.
- Instalación de R.
- Instalación de R Studio.
- Partes de R: consola y primeros comandos.
- Funciones y objetos en R.
- Partes de R Studio.
- Optimización de R Studio.
- Bajada de paquetes.
- Otras herramientas GUI.
Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS
- Uso de carpetas y ubicaciones.
- Creación de ficheros y objetos.
- Empezar con el caso de estudio.
Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS
- Introducción a los tipos de datos y estructuras.
- Vectores y operaciones con vectores.
- Matrices.
- Marcos de datos.
- Listas y arrays.
- Operaciones con texto.
- Otros tipos.
Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS
- Operaciones básicas para conocer los objetos.
- Operaciones de un tipo de dato a otro.
- Transformación en marcos de datos.
- Innovaciones en R (tidyverse).
- Optimización del código mediante el tidyverse.
Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS
- Gráficos del paquete básico.
- Otras operaciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 6: GGPLOT
- Filosofía de ggplot.
- Operaciones básicas de ggplot.
- Boxplots.
- Histogramas y densidad.
- Scatterplots.
- Barras, etc.
- Trucos.
- Leyendas, etiquetas, posiciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE
- Introducción a la programación y justificación.
- Bucles for.
- Bucles while.
- Condicionales if else.
- Resolviendo problemas de las simulaciones.
- Creación de funciones I.
- Creación de funciones II.
- Funciones de la familia apply.
Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS
- Ayuda de R.
- Stack overflow.
- GitHub.
Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R
- Introducción a R markdown.
- Generación de trozos de código.
- Operar con imágenes.
- Operar con tablas.
- Operar con índices.
- Otros tipos.
Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA
- Visión general de la estadísitca en R.
- Primeros pasos de la estadística básica en R.
- Distribuciones.
- Obtención de algunos parámetros de los modelos.
- Estadística no paramétrica.
- Introducción a modelos más complejos.
- Ejercicio guiado.
#tallerRonline2019
See more in TwitterList of participants
| Nº | Name | Organization |
|---|---|---|
| 1 | González Montelongo Cristina | Herbario TFC. Universidad de La Laguna |
| 2 | Scheinsohn Vivian | CONICET-INAPL/UBA |
| 3 | Calero Blanco Belén | Universidade de Vigo-Instituto Español de Oceanografía |
| 4 | Cantarell Gabriela Fabiana | Sistema de Información de Biodiversidad de la Administración de Parques Nacionales (Argentina) |
| 5 | Albero Ruiz Blanca | Universidad Autónoma de Madrid (UAM) |
| 6 | Salmerón Jiménez Francisca | Instituto Español de Oceanografía - Málaga |
| 7 | Iriarte Hebe Jorgelina | Instituto Multidisciplinario de Investigaciones Biológicas de San Luis - CONICET (Argentina) |
| 8 | Mas Gisbert Hugo | VAERSA |
| 9 | Espinosa Rincón Mónica | Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha |
| 10 | Balsalobre Agustín | Centro de Estudios Parasitologicos y de Vectores (CEPAVE-CONICET-UNLP) (Argentina) |
| 11 | Ronquillo Ferrero Cristina | Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC) |
| 12 | Ruiz Guzmán Javier | Herbario COFC. Universidad de Córdoba |
| 13 | Yañez Agustina | Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia" |
| 14 | Alcalde Olivares Cristina | Junta de Castilla y León - Servicio Territorial de Medio Ambiente de Soria |
| 15 | Galvalisi Paola Georgina | Instituto de Biología Subtropical (CONICET-UNaM), nodo Posadas (Argentina) |
| 16 | Alameda Manzanares Alejandro | Agencia de Gestión Agraria y Pesquera de Andalucía |
| 17 | Moreno Sancho María del Carmen | Tragsatec |
| 18 | Baringo Fonseca Clara | SiBBR- Brasil |
| 19 | Ruiz Reyes Oscar | Alburen Consultoría Medioambiental, S.L. |
| 20 | Arnal Olivares Alberto-Rafael | IMIDRA |
| 21 | Coturel Eliana | Facultad de Ciencias Naturales y Museo, Universidad Nacional de La Plata (Argentina) |
| 22 | Chocho Sánchez Víctor | Ministerio del Ambiente (Ecuador) |
| 23 | Palero Pastor Ferran | Centre d'Estudis Avançats de Blanes (CEAB-CSIC) |
| 24 | Souto Domínguez Mónica | Novotec Consultores, S.A. |
| 25 | Iturribarria Ruiz Marta | Gobierno Vasco |
| 26 | Buitrago Leonardo | SiB Colombia - Instituto Humboldt |
| 27 | Lansac Nieto Claudia | Real Jardín Botánico (RJB-CSIC) |
| 28 | Blanco González Jon | Real Jardín Botáncio (RJB-CSIC) |
| 29 | Rodríguez Arias Lucía | Universidad de Cádiz |
| 30 | de la Cruz Muñoz Andrés | Universidad de Cádiz |
| 31 | Haro Barba Carmen | Universidad Rey Juan Carlos - Intermediae Matadero Madrid |
| 32 | Juárez Peña Carlos Eduardo | Programa de Conservación de Murciélagos de El Salvador (PCMES)-ATVES |
| 33 | Solana Mena Alicia | Management & Ecology of Malasyan Elephants (MEME, Malasia) |
| 34 | Matheu de Cortada Eloïsa | Museu de Ciències Naturals de Barcelona |
| 35 | López Collar Diego | Universidad Complutense de Madrid |
| 36 | del Álamo Montes Marina | Centro de Colecciones Científicas de la Universidad de Almería (CECOUAL) |
| 37 | Peralta Cornejo Francisco José | UGR/AECOM |
| 38 | Botey Blanca | IC5Team |
| 39 | Casañas Machín Iván | Instituto Español de Oceanografía - Tenerife |
| 40 | Languasco María Paola | Fundación Miguel Lillo (Argentina) |
| 41 | Atienza Ariznavarreta Dacha | Consorci Museu de Ciències Naturals de Barcelona |
| 42 | Alfaro Saiz Estrella | Herbario LEB. Universidad de León |
| 43 | Márquez García Francisco | Instituto Investigación Agraria Finca La Orden. (CICYTEX) - Herbario HSS |
| 44 | Suárez Mayorga Ángela M. | Universidad Nacional de Colombia |
| 45 | Estrada Chavarría Armando | Museo Nacional de Costa Rica |
| 46 | Boet Escarceller Olga | CREAF |
| 47 | Fabado Alós Francisco Javier | Jardí Botànic de la Universitat de València |
| 48 | Quesada Ochoa Carmen | Herbario de la Universidad de Granada |
| 49 | García Alonso David | Centro de Investigaciones Científicas y Tecnológicas de Extremadura (CICYTEX, Junta de Extremadura) |