V Taller de Modelización de Nichos Ecológicos
La Unidad de Coordinación de GBIF en España organiza el quinto taller de modelización de nichos ecológicos. En este taller práctico se estudiarán los conceptos básicos para poder realizar análisis de datos biológicos a través de la modelización, así como el manejo de herramientas como Desktop GARP o MaxEnt.
Miércoles 6 de Mayo
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Programa
Martes 5 de Mayo
9:30 - 9:50 Introducción al taller: organización y planificación. Marco del taller: GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
09:50 - 10:15 Introducción a la Bioinformática
10:15 - 11:15 Conceptos para la correcta utilización de los datos cartográficos. (Alicia Gómez)
o Conceptos básicos sobre cartografía.
o Conceptos básicos sobre geodesia.
o Teledetección.
11:15 - 11:45 Pausa para café
11:45 - 13:00 Bases conceptuales para la modelización del nicho ecológico.
o Nicho fundamental versus nicho realizado.
o La modelización matemática del nicho realizado.
o Del espacio ecológico al espacio geográfico.
o El proceso de modelización: esquema conceptual.
13:00 - 13:30 Los modelos de nicho ecológico.
o Etapas en la construcción de un modelo de nicho ecológico.
o Limitaciones de los modelos de nicho.
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:00 Disponibilidad, tipo y acceso a los datos
o Los datos biológicos.
o Los datos ambientales.
o Salidas de los modelos.
16:00 - 18:00 Prácticas: descargar datos de GBIF, repaso del uso de los SIG (con pausa de media hora para café)
Miércoles 6 de Mayo
9:30 - 10:00 Limitaciones metodológicas:
o Las cuestiones de escala.
o ¿Cómo elegir las variables ambientales a incluir en el modelo?
10:00 - 11:00 Evaluación y validación del modelo
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 12:30 ¿Qué modelo (software) elegir?
o BIOCLIM
o DOMAIN
o GARP
o MAXENT
12:30 - 13:30 Interfaz BIOCLIM e Interfaz DOMAIN
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:30 Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en GARP
16:30 - 18:00 Modelización con BIOCLIM y DOMAIN (con pausa de media hora para café)
Jueves 7 de Mayo
9:30 - 11:00 Prácticas con GARP
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 13:30 Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en MAXENT.
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:30 Prácticas con MAXENT
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 - 18:00 Interpretación de resultados GARP vs. MAXENT (basado en ejemplos)
Viernes 8 de Mayo
9:30 - 10:00 Aplicaciones de los modelos de nicho a estudios de Cambio Global y Biología de la Conservación.
10:00 - 10:45 Prácticas y resolución de dudas
10:45 - 11:00 Evaluación del taller
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 13:30 Debate, dudas y sugerencias
Attached Documents
Vídeos del tallerDocuments of Interest
Conceptos para la correcta utilización de los datos cartográficos. Alicia Gómez (Fichero .PDF; 2.32Mb). Introducción al taller. Elisa Liras (Fichero .PDF; 402Kb). Introducción a la Bioinformática. Elisa Liras (Fichero .PDF; 2.29 Mb) Bases conceptuales para la modelización de nicho ecológico. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.95 Mb). Los modelos de nicho ecológico. Elisa Liras (Fichero .PDF; 800Kb). Disponibilidad, tipo y acceso a los datos. Elisa Liras (Fichero .PDF; 3.41Mb). Prácticas I. Descargar datos de GBIF, repaso del uso de los SIG. Elisa Liras (Fichero .PDF; 4.51Mb). Limitaciones metodológicas. Elisa Liras (Fichero .PDF; 803 Kb). Evaluación y validación del modelo. Elisa Liras (Fichero .PDF; 486 Kb). Qué modelo elegir. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.06 Mb). Interfaz BIOCLIM e Interfaz DOMAIN. Elisa Liras (Fichero .PDF; 2.33 Mb). Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en GARP. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.06 Mb). Modelización con BIOCLIM y DOMAIN. Elisa Liras (Fichero .PDF; 152Kb)./li> Prácticas II con GARP. Elisa Liras (Fichero .PDF; 230 Kb). Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en MAXENT. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.86 Mb) Interpretación de resultados GARP vs. MAXENT. Elisa Liras (Fichero .PDF; 199 Kb) Aplicaciones de los modelos de nicho a estudios de Cambio Global y Biología de la Conservación. Elisa Liras (Fichero .PDF; 3.65 Mb). Ejemplo. Elisa Liras (Fichero .PDF; 400 Kb). GARP para torpes. Javier Seoane (Fichero .PPT; 697 Kb). DesktopGarp: manual de usuario. DesktopGarp: preguntas frecuentes. DIVA-GIS versión 5.2: manual de usuario. Separatas
List of participants
| Nº | Name | Organization |
|---|---|---|
| 1 | Viruel Sánchez Juan | |
| 2 | Marques Isabel | CSIC-Real Jardín Botánico |
| 3 | Eugenio Gonzalbo Marcia | |
| 4 | Alba Sánchez Mª Francisca | |
| 5 | Errea Abad Maria Paz | |
| 6 | Morán Ordóñez Alejandra | |
| 7 | Lois Lugilde Sabela | |
| 8 | Terrones Contreras Beatriz | |
| 9 | López Senespleda Eduardo | |
| 10 | Coronado Villar Guillermo | |
| 11 | Barea Azcón José Miguel | |
| 12 | Alonso Ponce Rafael | |
| 13 | Uriarte Arandia Lorena | |
| 14 | Rubio Teso María Luisa | |
| 15 | Chacón Labella Julia | |
| 16 | Vilches de la Serna Beatriz | |
| 17 | González Oreja José Antonio | |
| 18 | Arana Navaridas Luisa | |
| 19 | Torralba Burrial Antonio | Dpto. Biología de Organismos y Sistemas, Universidad de Oviedo |
| 20 | Cabezas Fuentes Francisco José | CSIC-Real Jardín Botánico |
| 21 | Aguilar González María | CSIC-Real Jardín Botánico |
| 22 | Peralta de Andrés Javier | Servicio de Herbario de la Universidad Pública de Navarra, Departamento de Ciencias del Medio Natural. Universidad Pública de Navarra.[Herbario] |
| 23 | Montagud Alario Sergio |