VI Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Descripción
Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.
El taller es parte del programa de cursos de especialización del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que extenderá un certificado de aprovechamiento del mismo para aquellos/as alumnos/as que superen los objetivos marcados.
Metodología
El presente taller se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídeo tutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.
El taller se imparte en línea y permanece activo y con soporte de los instructores durante dos semanas. Dentro del periodo en el que está abierto el taller, el alumno puede organizarse el tiempo como estime oportuno, aunque siguiendo la estructura temática establecida. El tiempo estimado para completarlo es de 30 horas.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar el formulario de inscripción hasta el 4 de noviembre de 2024.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 18 de noviembre de 2022.
- La lista de alumnos admitidos y confirmados se publicará en la página web del taller el 25 de noviembre de 2024.
Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados. A la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM.
Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. No obstante, puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.
Programa
Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO
- Presentación del profesorado.
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
Módulo 1: INTRODUCCIÓN
- Qué es R.
- Instalación de R.
- Instalación de R Studio.
- Partes de R: consola y primeros comandos.
- Funciones y objetos en R.
- Partes de R Studio.
- Optimización de R Studio.
- Bajada de paquetes.
- Otras herramientas GUI.
Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS
- Uso de carpetas y ubicaciones.
- Creación de ficheros y objetos.
- Empezar con el caso de estudio.
Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS
- Introducción a los tipos de datos y estructuras.
- Vectores y operaciones con vectores.
- Matrices.
- Marcos de datos.
- Listas y arrays.
- Operaciones con texto.
- Otros tipos.
Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS
- Operaciones básicas para conocer los objetos.
- Operaciones de un tipo de dato a otro.
- Transformación en marcos de datos.
- Innovaciones en R (tidyverse).
- Optimización del código mediante el tidyverse.
Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS
- Gráficos del paquete básico.
- Otras operaciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 6: GGPLOT
- Filosofía de ggplot.
- Operaciones básicas de ggplot.
- Boxplots.
- Histogramas y densidad.
- Scatterplots.
- Barras, etc.
- Trucos.
- Leyendas, etiquetas, posiciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE
- Introducción a la programación y justificación.
- Bucles for.
- Bucles while.
- Condicionales if else.
- Resolviendo problemas de las simulaciones.
- Creación de funciones I.
- Creación de funciones II.
- Funciones de la familia apply.
Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS
- Ayuda de R.
- Stack overflow.
- GitHub.
Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R
- Introducción a R markdown.
- Generación de trozos de código.
- Operar con imágenes.
- Operar con tablas.
- Operar con índices.
- Otros tipos.
Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA
- Visión general de la estadísitca en R.
- Primeros pasos de la estadística básica en R.
- Distribuciones.
- Obtención de algunos parámetros de los modelos.
- Estadística no paramétrica.
- Introducción a modelos más complejos.
- Ejercicio guiado.