Gbif.es » Formación y divulgación » Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank

Taller

Tipo

Presencial

Fecha comienzo Taller

25/03/2014

Fecha fin Taller

26/03/2014

Lugar

Aula de informática del Real Jardín Botánico (CSIC)

Dirección

Edificio de Investigación. C/ Claudio Moyano 1.

Cómo llegar

Link Google Maps

A cargo de

Isabel Rey (Museo Nacional de Ciencias Naturales-CSIC) y Francisco Pando (GBIF.ES)

Colabora

María Paz Martín (Real Jardín Botánico-CSIC) y Mauricio Velayos (Real Jardín Botánico-CSIC)

Idioma

Castellano

Máximo nº de participantes

Horas estimadas de dedicación

Contacto

info@gbif.es

Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank

Descripción:

El avance de los estudios de biodiversidad de la mano de las técnicas moleculares y nuevos enfoques ecológicos en tiempos recientes ha sido espectacular. Sin embargo, la falta de procedimientos y prácticas para hacer las conclusiones de estos estudios revisables, pone en cuestión la solidez y validez científica de los mismos en muchos casos. En este contexto, la importancia de los ejemplares de colecciones como pilar del método científico en estos estudios es cada vez más reconocida y aceptada. Esta situación es una oportunidad para las colecciones, si al publicar sus datos en línea lo hacen con enlaces al GenBank y si colaboran con los repositorios de GenBank para que desde los mismos se enlacen a los ejemplares de respaldo. El cómo hacerlo es el objeto de este taller.

Programa

Martes 25 de marzo de 2014

09:30 - 10:00

Bienvenida e introducción al curso
GBIF y la información primaria sobre biodiversidad

10:00 - 11:00

Qué es el GenBank - Isabel Rey (MNCN)
Qué son las colecciones de tejidos y ADN - Isabel Rey (MNCN)

11:00 - 11:30 Pausa café

11:30 - 13:30

El papel de las colecciones de historia natural en los estudios moleculares - María Paz Martín (RJB)
La iniciativa "Barcode of Life" y las colecciones - Francisco Pando (GBIF.ES)

13:30 - 15:00 Pausa comida

15:00 - 17:00 (30' para café)

Implicaciones para las colecciones. Muestreos destructivos
- Principios generales y colecciones botánicas - Mauricio Velayos (RJB)
- Aspectos específicos de las colecciones zoológicas – Isabel Rey (MNCN)
Debate: el tema de los materiales testigo, su citación: buenas y malas prácticas

Miércoles 26 de marzo de 2014

9:30 - 11:00

Las bases de datos del GenBank (presentación estructura, información que contiene, identificadores) - Francisco Pando (GBIF.ES)
Cómo tratar la información molecular en las colecciones de HN y sus implicaciones en los procedimientos de trabajo y sus bases de datos - Isabel Rey (MNCN) y Francisco Pando (GBIF.ES)

11:00 - 11:30 Pausa café

11:30 - 13:00

Cómo colaborar con GenBank para enlazar la información de las secuencias con las bases de datos en línea de las colecciones - Francisco Pando (GBIF.ES)

13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del taller

Documentos Adjuntos

Documentos de Interés

01.- Guión de prácticas (.docx) 02.- Ejemplo tabla linkout.mdb (.zip) 03.- Archivo MAFungiAccessions.ft (.zip) 04.- Archivo MAFungiGenbank.ft (.zip)

Listado de Participantes

Nº	Nombre	Organización
1	Fernández García Marta	CSIC-Real Jardín Botánico
2	Benhadi Marín Jacinto	Centro de Investigação de Montanha - Instituto Politécnico de Bragança - Portugal
3	Ros Díaz Rosa María	SERVET Formación CB
4	Cano Cabezas Emilio	CSIC-Real Jardín Botánico
5	Moreno Casado Carlos Jaime	CSIC-Real Jardín Botánico
6	Calvo Revuelta Marta	Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
7	López Errasquin Elena	Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC, Madrid)
8	García Martín Joaquina María	CSIC-Real Jardín Botánico
9	Mattos Reaño Jean	Museo de Historia Natural de Lima - Perú
10	Fernández López Javier	CSIC-Real Jardín Botánico
11	García Cancela Ramón	CENTRO OCEANOGRÁFICO DE MÁLAGA DEL INSTITUTO ESPAÑOL DE OCEANOGRAFÍA
12	Ariza Molina María Jesús	Universidad de Sevilla, Dpto. Biología Vegetal y Ecología. [Herbario]
13	García Ibáñez Eva	CSIC-Real Jardín Botánico
14	Baranda Ortiz María Concepción	CSIC-Real Jardín Botánico
15	Lumbreras Corujo Ana	Universidad de Evora - Portugal
16	Herrero Nieto Alberto	CSIC-Real Jardín Botánico
17	Noya Santos Rosario	CSIC-Real Jardín Botánico
18	García San León David	Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario]
19	Nualart Dexeus Neus	Instituto Botánico de Barcelona (CSIC - Ayuntamiento de Barcelona) [Herbario]
20	Dueñas Carazo Margarita	CSIC-Real Jardín Botánico
21	Sánchez Chillón Begoña	Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
22	García Franquesa Eulàlia	Museo de Ciencias Naturales de Barcelona (MCNB)
23	Montagud Alario Sergio	Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva